Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP54Q7Z3B4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms