Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYDE1Q6ZW31 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYDE1Q6ZW31 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms