Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00299Q6ZSB3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms