Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFXL1Q6ZNB6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms