Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRAIDQ6UW56 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATRAIDQ6UW56 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms