Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC171Q6TFL3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms