Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF7Q6Q0C0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF7Q6Q0C0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms