Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARFGEF3Q5TH69 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms