Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHF19Q5T6S3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms