Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NHSL1Q5SYE7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHSL1Q5SYE7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms