Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CATSPEREQ5SY80 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPEREQ5SY80 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms