Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP188Q5SRE5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP188Q5SRE5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms