Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC158Q5M9N0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms