Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms