Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ODF2Q5BJF6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ODF2Q5BJF6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms