Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNNI3KQ59H18 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNI3KQ59H18 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms