Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D3Q587I9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms