Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q56UQ5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q56UQ5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q56UQ5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q56UQ5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q56UQ5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Q56UQ5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Q56UQ5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Q56UQ5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Q56UQ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Q56UQ5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Q56UQ5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q56UQ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q56UQ5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q56UQ5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q56UQ5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q56UQ5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q56UQ5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q56UQ5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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