Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF212Q495C1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF212Q495C1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms