Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWISTNBQ3B726 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms