Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FHOD3Q2V2M9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FHOD3Q2V2M9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms