Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ISXQ2M1V0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms