Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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