Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM187BQ17R55 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms