Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDK4Q16654 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDK4Q16654 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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