Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCBQ16585 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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