Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSRP2Q16527 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSRP2Q16527 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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