Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS72Q15906 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
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