Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USF2Q15853 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USF2Q15853 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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