Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITSN1Q15811 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms