Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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ATXN8Q156A1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ATXN8Q156A1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ATXN8Q156A1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ATXN8Q156A1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ATXN8Q156A1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ATXN8Q156A1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ATXN8Q156A1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ATXN8Q156A1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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