Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TAF1AQ15573 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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TAF1AQ15573 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TAF1AQ15573 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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