Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SS18Q15532 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SS18Q15532 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SS18Q15532 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SS18Q15532 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SS18Q15532 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SS18Q15532 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SS18Q15532 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SS18Q15532 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SS18Q15532 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SS18Q15532 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SS18Q15532 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SS18Q15532 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SS18Q15532 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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