Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRKQ15262 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRKQ15262 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
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