Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCOLCEQ15113 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCOLCEQ15113 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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