Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GAPVD1Q14C86 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GAPVD1Q14C86 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms