Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GPNMBQ14956 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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