Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SSPNQ14714 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSPNQ14714 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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