Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF235Q14590 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF235Q14590 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms