Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEMA3AQ14563 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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