Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDK13Q14004 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDK13Q14004 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms