Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LAMB3Q13751 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LAMB3Q13751 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms