Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KRR1Q13601 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRR1Q13601 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRR1Q13601 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRR1Q13601 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRR1Q13601 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRR1Q13601 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRR1Q13601 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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