Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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IRF5Q13568 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF5Q13568 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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