Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PKD2Q13563 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2Q13563 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
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