Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
NEUROD1Q13562 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEUROD1Q13562 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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