Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMAD4Q13485 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAD4Q13485 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms