Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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ERCC8Q13216 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ERCC8Q13216 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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