Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF3Q13114 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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TRAF3Q13114 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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TRAF3Q13114 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF3Q13114 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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