Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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GPS1Q13098 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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GPS1Q13098 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPS1Q13098 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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